Polymorphism of microsatellite loci of primocane raspberry as a basis for genetic certification of varieties
Abstract
Microsatellite DNA markers are currently effectively used in studying the genetic diversity of berry crops and DNA certification of varieties.
Using the data of SSR analysis, molecular genetic passports were compiled for 48 samples of primocane raspberry (44 varieties, 4 hybrids), 7 of which are of Belarusian selection, 21 – Russian, 5 – Ukrainian, 5 – Polish, 4 – Dutch, 3 – Swiss, 1 – Romanian, 1 – English and 1 – American. Among the genotypes assessed, 5 samples are distinguished by the yellow color of the berries. 8 microsatellite SSR markers were used to create the passports. As a result, a high level of polymorphism of these microsatellite loci was shown and 113 alleles were identified. Depending on the locus, the number of alleles varied from 6 to 26. The RhM043 locus turned out to be the most polymorphic, and the RhM001 locus turned out to be the least polymorphic.
According to the results of research, the article presents a catalog of 13 genetic passports of primocane raspberry varieties included in the State Register of Agricultural Plant Varieties and being tested by the State Inspection for Testing and Protection of Plant Varieties of the Republic of Belarus.
About the Authors
T. A. GashenkoBelarus
L. V. Fralova
Belarus
V. A. Gashenko
Belarus
References
1. О Государственной комплексной программе развития картофелеводства, овощеводства и плодоводства в 2011– 2015 годах [Электронный ресурс] : постановление Совета Министров Респ. Беларусь, 31 дек. 2010 г., № 1926 / Нац. правовой Интернет-портал Респ. Беларусь. – Режим доступа: https://pravo.by/document/?guid=3961&p0=C21001926. – Дата доступа: 01.02.2024.
2. Фролова, Л. В. Современные направления селекции малины / Л. В. Фролова, Т. А. Гашенко, О. А. Гашенко // Плодоводство : сб. науч. тр. / Ин-т плодоводства ; редкол.: А. А. Таранов (гл. ред.) [и др.]. – Минск, 2021. – Т. 33. – С. 211–226.
3. Сорта плодовых, ягодных, орехоплодных культур и винограда, включенные в государственный реестр сортов сельскохозяйственных растений и находящиеся на испытании в Государственной инспекции по испытанию и охране сортов растений / РУП «Ин-т плодоводства» ; отв. за вып. В. В. Васеха. – Самохваловичи : [б. и.], 2024. – 32 с.
4. Microsatellite markers for raspberry and blackberry / N. R. F. Castillo [et al.] // J. of the Amer. Soc. for Horticultural Sci. – 2010. – Vol. 135. – P. 271–278.
5. Graham, J. Raspberry breeding / J. Graham, N. Jennings // Breeding plantation tree crops: temperate species / ed.: P. M. Priyadarshan, S. Mohan Jain. – New York, 2009. – P. 233–248.
6. AFLP-based genetic relationships in wild and cultivated raspberry genotypes (Rubus idaeus L.) / S. Ercisli [et al.] // Biotechnology & Biotechnological Equipment. – 2008. – Vol. 22, № 4. – P. 907–910.
7. Соболев, В. В. Использование метода полимеразной цепной реакции для генетического маркирования ремонтантной малины : автореф. … дис. канд. биол. наук : 03.00.23 / В. В. Соболев ; М. с.-х. акад. им. К. А. Тимирязева. – М., 2004. – 17 с.
8. Паспортизация сортов малины и ежевики и изучение их филогенетических взаимоотношений методом RAPD-анализа / Д. И. Каган [и др.] // Биотехнологические приемы в сохранении биоразнообразия и селекции растений : материалы Междунар. науч. конф., Минск, 18–20 авг. 2014 г. / Центр. ботан. сад Нац. акад. наук Беларуси ; редкол.: В. Н. Решетников (отв. ред.) [и др.]. – Минск, 2014. – С. 101–104.
9. Гашенко, Т. А. Изучение генетического разнообразия образцов малины с использованием SSR-маркеров / Т. А. Гашенко, Л. В. Фролова, Т. Н. Божидай // Плодоводство : сб. науч. тр. / Ин-т плодоводства ; редкол.: А. А. Таранов (гл. ред.) [и др.]. – Минск, 2023. – Т. 35. – С. 54–61.
10. Гашенко, Т. А. Молекулярно-генетическая паспортизация районированного сортимента малины в Беларуси / Т. А. Гашенко, Л. В. Фролова, З. А. Козловская // Современные технологии сельскохозяйственного производства : сб. науч. ст. XXIV Междунар. науч.-практ. конф. (Гродно, 23 марта, 14 мая 2021 г.) : к 70-летию образования университета. Агрономия. Защита растений. Технология хранения и переработки сельскохозяйственной продукции / М-во сел. хоз-ва и продовольствия Респ. Беларусь, Гродн. гос. аграр. ун-т. – Гродно, 2021. – С. 65–66.
11. Graham, J. DNA markers for use in raspberry breeding / J. Graham, K. Smith // Acta Horticulturae. – 2002. – Vol. 585. – P. 51–56.
Review
For citations:
Gashenko T.A., Fralova L.V., Gashenko V.A. Polymorphism of microsatellite loci of primocane raspberry as a basis for genetic certification of varieties. Fruit Growing. 2024;36:58-64. (In Russ.)